X档案关闭后，穆德（大卫·杜楚尼饰）和斯高丽（吉莲·安德森饰）被分开。Mulder奉命执行监视工作，而Scully则返回学院学习。有一天，国会议员马特森（雷蒙德·J·巴里饰）向穆德透露了一条信息，称他收到了来自波多黎各外星人的信息。为了在特种部队面前找到外星人存在的证据，Mulder只身前往。得知消息后，Scully赶到了Mudd的住处，从电脑里的旅客名单中找到了线索，跟随他来到了波多黎各。在波多黎各的阿雷西博，穆德遇到了当地人，并从他那里得到了一幅外星人的画作。但不久之后，这个人就离奇死亡了。穆德最终会找到外星人来访的证据吗？
