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主人公翔子是流星学园的中学生。她的亲妹妹广子自五年前出国留学以来一直失踪。有一天，一个不知名的人突然向祥子报仇。为她报仇的，是昔日被雅典娜女神封印的邪神厄里斯的部下恶灵。于是翔子得知了雅典娜、圣斗士星矢、圣斗士少女的存在，同时也知道了自己和妹妹的残酷命运。灵魂被封印的邪神厄里斯即将复活，恶灵也活跃起来。在圣哉等人与汉朝的战争和与十二宫的激战的另一边，沙织和圣斗少女借助黄金圣斗士的力量展开了与恶灵的英勇战斗！而且，邪恶的佐贺也有复活的迹象……掌握着完美钥匙的，就是刚刚开始修炼成为圣头女的翔子！尽管她们被残酷的命运打败了，但女孩们仍然抗拒命运。少女与众神之间的英勇战斗的故事开始了！
