三国时期，战争爆发。年轻的华佗在家乡亳州待人，过着洒脱的生活。华佗灵巧的手使太守的女儿明心起死回生，获得了神医的美誉。为了研制麻非散给明心治疗眼睛，华佗开始四处游历寻药。在京城，华佗与英雄关羽、汉奸曹操和他的师兄吴思德频繁相遇，看到了阴森的官场和灼热的世界。最让华佗伤心的是，心爱的少女明心被吴思德挪用了。东吴山中，绝望的华佗得到隐士的指点，顿时清醒过来，立志成为医治人心、医治国度的大医。赤壁之战，刮骨解毒，秘境冒险。尽管风雨交加，但从未改变拯救苍生的纯洁之心。马飞散的研制成功也让华佗和明心的关系结出硕果，但幸福来临时，曹操却因病、疑、恨而将华佗抓获。死于狱中。
