恐怖分子在教堂传播病毒，导致俄罗斯东部一座城市几乎消失。同样的厄运即将降临日本，日本警视厅准备参与其中，并请18岁的天才黑客藤丸高木（三浦春马饰）协助。藤丸的父亲也是一名警察，原本负责此案，但后来因涉嫌误杀而被通缉。恐怖结构的织原麻纱（吉濑美智子饰）进入藤丸的高中担任生物老师，并监督藤丸。为了保护妹妹逍遥的生命安全，藤丸不得不同意恐怖组织的要求，将电厂管理员的密码窃取给对方。在一家百货公司，致命的血腥-x病毒被怀疑是由小丑传播的。好在藤丸及时发现病毒是假的，是虚惊一场。但就在众人暂时松了口气的时候，恐怖组织已经开始迈出真正的第一步了。BloodyMonday是所有死者的硬道理，也是最大的秘密和阴谋。
