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16年前，射手座黄金圣斗士艾俄洛斯怀抱真正的女神雅典娜转世，逃离圣域。途中遭到双子座萨卡和摩羯座修拉的袭击，身受重伤。命运的趋势之下，身处危难前线的艾欧洛斯将女神托付给了刚来喜马拉雅探险的日本木户财团会长木户光政（大杉莲配音）。广政知道前因后果，将女神带回日本，给她取名沙织，假借孙女之名抚养长大。在命运和女神的感召下，圣哉（石川海莲配音）、子龙（赤羽健二配音）、冰河（小野宪章配音）、瞬（冈本信彦配音）等经过艰苦训练的少年回到了日本。一个接一个。他们已经成长为能够自立的圣人。与此同时，教皇命令的刺客们陆续从圣域来到日本，一场足以载入史册的正邪之战开始了……
